PCR實驗室又稱基因擴增實驗室，其特點是能將微量的DNA大幅增加，PCR是分子生物學研究和實驗的常規方法，廣泛應用于生物學各個領域。例如：艾滋病檢測、乙型肝炎、禽疫病、癌基因的檢測和診斷，DNA指紋、個體識別、親子鑒定及法醫物證、動植物檢疫，動物及其衍生產品檢測，動物飼料、化妝品、食品衛生檢測，轉基因作物與轉基因微生物檢測等。

　　原則上分為四個區域：試劑準備區、樣品制備區、擴增區和擴增產物分析區。

　　PCR實驗室原則上為試劑準備區、樣品制備區、擴增區和擴增產物分析區四個單獨的工作區域并設有專用走廊，各工作區域應設緩沖間，工作區與緩沖間宜安裝連鎖裝置。不同功能的工作區應是分隔獨立的，各工作區有明顯的標志，不能直通，如果緊密相連，需安裝物品傳遞窗。

　　PCR實驗室區域的設置并不是一成不變的，以下幾種情況需要說明：

　　1.如果樣本在擴增之前需要粉碎處理，則需要增加一個區域用于樣品的粉碎。

　　2.如果采用實時熒光PCR法，則擴增區和分析區可以合并為一個區。

　　3.如果采用全自動化PCR分析儀，則標本制備區、擴增區和分析區可以合并為一個區。

　　四個區域注意正壓負壓的控制：

　　1.試劑準備區：

　　主要進行試劑的制備、分裝和主反應混合液的制備。試劑和用于樣品制作的材料應直接運送至該區，不得經過其它區域。試劑原材料必須貯存在本區內，并在本區內制備成所需的試劑。本區主要設備有天平、冰箱、離心機、加樣器、振蕩器等。

　　對于氣流壓力的控制，本區并沒有嚴格的要求。

　　2.樣品制備區：

　　主要進行樣品的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴增反應管和測定DNA的合成。本區主要設備有冰箱、生物安全柜、離心機、加樣器、振蕩器、恒溫水浴等。

　　本區的壓力梯度要求為：相對于鄰近區域為正壓，以避免從鄰近區進入本區的氣溶膠污染。

　　3.擴增區：

　　該區域的功能是DNA擴增和擴增片段的測定。此外，反應混合液(來自試劑貯存和制備區)制備成反應混合液和已制備的DNA模板(來自標本制備區)的加入等也可在本區內進行。對于氣流壓力的控制，相對于鄰近區域為負壓，以避免氣溶膠從本區漏出。為避免氣溶膠所致的污染，應盡量減少在本區內不必要的走動。個別操作如加樣等應在超凈臺內進行。

　　該區域的設備主要是核酸擴增熱循環儀、加樣器、超凈臺等。其中熱循環儀的電源應專用，并配備一個穩壓電源或UPS，以防止由于電壓的波動對擴增測定的影響主要進行DNA擴增。

　　本區的壓力梯度要求為：相對于鄰近區域為負壓，以避免氣溶膠從本區漏出。

　　4.擴增產物分析區：

　　擴增產物的測定。本區主要設備有酶標儀、洗板機、加樣器和水浴箱等。

　　本區的壓力梯度的要求為：相對于鄰近區域為負壓，以避免擴增產物從本區擴散至其它區域。